2005年，中国物流尽管去的重大进展，进入理性、务实、快速发展的新阶段，但存在的问题同样不容忽视，特别是一些影响物流长远发展的深层次问题有待解决，我国物流发展仍然处于初级阶段。
一、供需不平衡的结构性矛盾依然存在

社会化的物流需求不足与专业化的物流供给不够，是制约中国物流发展的主要矛盾，也是2005年中国物流发展的主要问题，并将成为今后物流发展必须跨越的一个门槛。一方面，物流需求聚集和释放的速度不快，“大而全”、“小而全”的企业物流运作比例还比较大；另一方面，物流服务供给能力还不能满足需求，特别是高端需求、及时需求、特色需求、一体化需求满足率不高。需求不足与供给不够并存，我留资源短缺与物流服务过剩同在。
还有，东、中、西部区域物流发展不平衡，资源县地区流出量与流入量差距很大；呈现物流发展不平衡，农产品物流与农资物流发展滞后；行业物流发展不平衡，部分传统产业物流模式转型不快；各物流环节发展不平衡，供应物流和生产物流的分离外包慢于销售物流；基础性服务与增值性服务发展不平衡，增值性服务所占比例仍然不断；多种运输方式衔接不够，配套不好；公路运力相对过剩，铁路运能依然不足；普通设施设备过剩，特种、专用设备不足；物流基础设施分数不同的地方、部门和行业，缺乏有效整合和充分利用。